Dès 1800, deux botanistes, Jean Le Chevalier et René Le Berriays, créateurs de la variété de poire nommée la Louise-Bonne d'Avranches, rassemblent 800 espèces et près de 2400 plantes (fleurs exotiques, arbres fruitiers, plantes médicinales).
Dans cette première moitié du XIXème siècle sont introduits dans le jardin : les camélias, le rosier de Chine, l'hortensia, les magnolias ainsi que les premiers rhododendrons importés de l'île de Java.
En 1842, la Société d'Archéologie fait installer dans le jardin le portail roman de la Chapelle Saint-Georges de Bouillé.
La fin du XIXème siècle et le début du XXème siècle font de ce jardin botanique, un véritable jardin des plantes : plantations d'arbustes, de pelouses, de massifs floraux. Aujourd'hui, le jardin compte un grand nombre d'arbres remarquables et des massifs en mosaiculture. Chaque soir en été une sonorisation invite les visiteurs à la promenade et à la découverte d'une vue unique sur la Baie du Mont Saint-Michel.
